El Vicerrectorado de Investigación es un órgano de alta dirección, dependiente del rectorado. Tiene a su cargo el rol de dirección, orientación y ejecución de actividades principales y sustantivas referidas al ámbito de la investigación de la Unajma. Integra el Consejo Universitario, coordina con los decanos de las facultades, jefes de departamentos y directores de las escuelas profesionales.